叛乱，徐敬业兵败被杀。

垂拱二年（686年）正月，武则天下诏，表示要还政于皇帝。李旦知道这是母后在试探于他，便数次上表，极力推辞，请求母后继续临朝。武则天遂顺水推舟，“接受”了李旦的请求，依旧临朝称制，把持朝政。

垂拱四年（688年），武承嗣将一块刻有“圣母临人，永昌帝业”八字的白石献给武则天，声称是在洛水中发现的。武则天大喜，将白石命名为“宝图”（后改称“天授圣图”），又加尊号为圣母神皇。

李旦作为皇帝，不但无法阻止，还要随武则天亲临洛水，参加“拜洛受图”大典。

当时，琅琊王李冲、越王李贞起兵反对武则天，结果都兵败身死。

韩王李元嘉、鲁王李灵夔、霍王李元轨、纪王李慎、江都王李绪、黄国公李撰、东莞郡公李融、常乐公主等，或被逼自杀，或斩首市曹，或死于流放途中。李唐宗室几乎被杀戮殆尽。

可能正是因为血腥看多了，所以为了保命，李旦一直都在做自己母后的乖宝宝，什么都听自己母后的，他认为这样就可以换得母后对自己的仁爱，可是事实总是那么的可笑。

天授元年（690年），侍御史傅游艺率关中百姓九百人上表朝廷，请武则天称帝。百官、宗室、外戚、四夷酋长，乃至僧尼、道士，纷纷劝进。李旦迫于形势，也上表请母后称帝，并求赐武姓。

是年九月，武则天正式称帝，尊号圣神皇帝，改国号为周，史称武周。

李旦被降为皇嗣，赐姓武氏，迁居东宫，一切礼仪皆比照皇太子规格。太子李成器则降称皇孙。

自此，李旦成为了武氏诸王以及酷吏的攻击目标，开始了艰难的皇嗣生涯。

为什么李旦会在此时哭泣，那是因为就在刚刚，魏王武承嗣的亲信张嘉福唆使洛阳百姓王庆之，纠集数百民众，诣阙上表，以“神不歆非类，民不祀非族”为由，请武则天废黜李旦的皇嗣身份，改立武承嗣为皇太子。

李旦很清楚，如此这次让武承嗣成功的话，那么他李旦就是必死无疑，所以李旦才会独自一人在东宫之中哭泣。

而就在李旦哭的不能自已的时候，东宫的大门被推开，一位面容似玉的少年走了进来，看到李旦之后，少年连忙走到了李旦的身边道“父王不要再哭了，孩儿已经想到办法了，这次父王一定会没事的。”

少年话一说完，李旦立即止住了眼泪看着少年道“成器你说的是真的吗，你真的想到办法了？”

看着自己懦弱的父亲，李成器微笑着安慰道“是真的父王，你放心好了，今天晚上我就为你奔走，定保你无事。”

“太好了，太好了，不器，谢谢你，父王谢谢你！”说着，终于李旦露出了一丝笑脸，将自己的这个长子李成器给紧紧的抱住。

此时李成器也露出微笑在心中微微道父王，成器会保护你一辈子的。